Protein–RNA interactions for Protein: Q571E5

Prss53, Serine protease 53, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss53Q571E5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prss53Q571E5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms