Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms