Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otol1Q4ZJM7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms