Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

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Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Herc2Q4U2R1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms