Protein–RNA interactions for Protein: Q4FJU9

Tmem40, Transmembrane protein 40, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem40Q4FJU9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tmem40Q4FJU9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem40Q4FJU9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tmem40Q4FJU9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem40Q4FJU9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tmem40Q4FJU9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem40Q4FJU9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tmem40Q4FJU9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tmem40Q4FJU9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem40Q4FJU9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem40Q4FJU9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tmem40Q4FJU9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem40Q4FJU9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tmem40Q4FJU9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tmem40Q4FJU9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem40Q4FJU9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem40Q4FJU9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem40Q4FJU9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem40Q4FJU9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem40Q4FJU9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem40Q4FJU9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem40Q4FJU9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem40Q4FJU9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem40Q4FJU9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem40Q4FJU9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem40Q4FJU9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem40Q4FJU9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem40Q4FJU9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem40Q4FJU9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem40Q4FJU9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem40Q4FJU9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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