Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam220aQ3ZN08 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam220aQ3ZN08 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms