Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6430531B16RikQ3V2J1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms