Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc110Q3V125 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms