Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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Dnah12Q3V0Q1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Dnah12Q3V0Q1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms