Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms