Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd53Q3V0J4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd53Q3V0J4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms