Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms