Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BB287469Q3UT53 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms