Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a11Q3USY0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a11Q3USY0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a11Q3USY0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms