Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Klhdc9Q3USL1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms