Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Znf48Q3US17 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Znf48Q3US17 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Znf48Q3US17 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Znf48Q3US17 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf48Q3US17 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Znf48Q3US17 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Znf48Q3US17 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Znf48Q3US17 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Znf48Q3US17 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Znf48Q3US17 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Znf48Q3US17 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Znf48Q3US17 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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