Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rtl4Q3URY0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rtl4Q3URY0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rtl4Q3URY0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rtl4Q3URY0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rtl4Q3URY0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rtl4Q3URY0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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