Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms