Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms