Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms