Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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