Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms