Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms