Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpr55Q3UJF0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms