Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms