Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms