Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms