Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zyg11bQ3UFS0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zyg11bQ3UFS0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zyg11bQ3UFS0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zyg11bQ3UFS0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zyg11bQ3UFS0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zyg11bQ3UFS0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zyg11bQ3UFS0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zyg11bQ3UFS0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zyg11bQ3UFS0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zyg11bQ3UFS0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zyg11bQ3UFS0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms