Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nom1Q3UFM5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms