Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms