Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam193bQ3U2K0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam193bQ3U2K0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam193bQ3U2K0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam193bQ3U2K0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam193bQ3U2K0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam193bQ3U2K0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam193bQ3U2K0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam193bQ3U2K0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam193bQ3U2K0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms