Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms