Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fndc4Q3TR08 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms