Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms