Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fubp3Q3TIX6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fubp3Q3TIX6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fubp3Q3TIX6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fubp3Q3TIX6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fubp3Q3TIX6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fubp3Q3TIX6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fubp3Q3TIX6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fubp3Q3TIX6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fubp3Q3TIX6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fubp3Q3TIX6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fubp3Q3TIX6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fubp3Q3TIX6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fubp3Q3TIX6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fubp3Q3TIX6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fubp3Q3TIX6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fubp3Q3TIX6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fubp3Q3TIX6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fubp3Q3TIX6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fubp3Q3TIX6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fubp3Q3TIX6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fubp3Q3TIX6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms