Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hddc2Q3SXD3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms