Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms