Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp8Q2V6D6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms