Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ush2AQ2QI47 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms