Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Samd11Q1RNF8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samd11Q1RNF8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samd11Q1RNF8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samd11Q1RNF8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samd11Q1RNF8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samd11Q1RNF8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samd11Q1RNF8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samd11Q1RNF8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd11Q1RNF8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd11Q1RNF8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd11Q1RNF8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd11Q1RNF8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd11Q1RNF8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd11Q1RNF8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd11Q1RNF8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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