Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Perm1Q149B8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Perm1Q149B8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms