Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc162pQ0VG85 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms