Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF94

Nkpd1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkpd1Q0VF94 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkpd1Q0VF94 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkpd1Q0VF94 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkpd1Q0VF94 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkpd1Q0VF94 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkpd1Q0VF94 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkpd1Q0VF94 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkpd1Q0VF94 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkpd1Q0VF94 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkpd1Q0VF94 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkpd1Q0VF94 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkpd1Q0VF94 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkpd1Q0VF94 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkpd1Q0VF94 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkpd1Q0VF94 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkpd1Q0VF94 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkpd1Q0VF94 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms