Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spata18Q0P557 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spata18Q0P557 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Spata18Q0P557 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spata18Q0P557 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spata18Q0P557 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Spata18Q0P557 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms