Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r181Q0P547 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms