Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms