Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gata4Q08369 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms