Protein–RNA interactions for Protein: Q08048

Hgf, Hepatocyte growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HgfQ08048 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HgfQ08048 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HgfQ08048 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HgfQ08048 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HgfQ08048 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HgfQ08048 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HgfQ08048 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HgfQ08048 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HgfQ08048 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms