Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ebf1Q07802 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms