Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MestQ07646 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MestQ07646 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MestQ07646 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MestQ07646 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MestQ07646 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MestQ07646 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MestQ07646 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MestQ07646 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MestQ07646 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MestQ07646 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MestQ07646 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MestQ07646 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MestQ07646 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MestQ07646 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MestQ07646 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MestQ07646 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MestQ07646 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MestQ07646 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MestQ07646 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MestQ07646 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MestQ07646 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MestQ07646 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MestQ07646 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MestQ07646 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MestQ07646 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MestQ07646 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MestQ07646 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MestQ07646 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MestQ07646 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MestQ07646 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MestQ07646 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MestQ07646 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MestQ07646 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MestQ07646 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MestQ07646 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MestQ07646 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MestQ07646 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MestQ07646 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MestQ07646 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MestQ07646 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MestQ07646 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MestQ07646 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MestQ07646 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MestQ07646 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MestQ07646 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MestQ07646 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MestQ07646 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MestQ07646 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MestQ07646 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MestQ07646 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MestQ07646 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MestQ07646 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MestQ07646 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MestQ07646 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MestQ07646 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MestQ07646 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MestQ07646 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MestQ07646 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MestQ07646 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MestQ07646 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MestQ07646 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MestQ07646 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MestQ07646 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MestQ07646 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MestQ07646 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MestQ07646 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms